固体废弃物处理及资源循环利用研究所前身是固废处理技术研究中心，2010开始，环境学院实行团队制建设，以研究所为单位构建的6个研究团队之一。以朱伟教授牵头的研究方向定为《固废处理与资源循环利用研究所》，由课题组的6位年轻教师构成。以团队的形式开展科研和教学工作。目前的主要研究方向有四个：
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河湖底泥处理与资源化利用:针对我国目前产生的大量清淤淤泥需要处理的问题。研究淤泥固化技术，污染淤泥的固/稳定化技术，吹填淤泥的堆场处理技术，以及清淤-输送-处理的一体化技术。
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污水厂污泥处理与资源化利用：针对我国污水处理行业产生大量剩余污泥的问题，研究污泥固化/稳定化预处理填埋技术，脱水污泥深度脱水技术以及污泥超临界处理资源化利用技术。
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蓝藻暴发机理研究：以太湖为对象，研究微囊藻群体化现象，动力学对蓝藻生长、繁殖、暴发的影响。
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湿地生态、环境效应研究：人工湿地堵塞问题，人工湿地植物释氧问题以及低碳源情况下的补充碳源方法等的研究。
