2009年9月16日，应日本滋贺县琵琶湖博物馆的邀请，朱伟老师与日本湖泊富营养化研究方面的专家进行了学术交流。本次交流的内容由琵琶湖博物馆策划，主题为：湖泊富营养化治理的问题--琵琶湖与太湖的对话。日本琵琶湖博物馆、琵琶湖研究所、以及北海道大学等湖泊及生态学研究的专家参加了交流。
    交流活动由琵琶湖博物馆从事硅藻研究的OOTSKA博士主持，朱伟老师以《中国太湖における富栄養化と生態復元について》为题作了学术报告。作为话题提供日本知名的蓝藻研究者TSTIMURA博士作了《琵琶湖的蓝藻问题及现状》的学术报告。报告后各位专家对太湖问题和琵琶湖的问题进行了热心、热烈的讨论。大家对湖泊富营养化问题表现出非常的关注。
    琵琶湖是日本最大的湖泊，也是世界上富营养化治理较为成功的湖泊之一。交流活动结束后，朱伟老师还对琵琶湖污水处理系统、农村面源控制系统、村落污水处理系统、湖滨带修复工程和流域的主要河流进行了考察。