太湖面积2338km2，是我国第三大淡水湖泊，正常水位下容积44.3亿m3（吴淞基面3.05m），平均水深1.89m，是一个典型的平原浅水型湖泊。80年代以前，太湖平均水质为Ⅱ类。80年代以来随着太湖流域工农业生产迅猛发展，废水排放量逐年增加，致使太湖水质日益恶化，富营养严重，成为太湖水环境的主要问题。
恢复太湖水体的生态功能是贯彻国家太湖水污染防治“九五”和“十五”计划的一个重要环节，要实现太湖水质和生态环境的好转，减轻水体富营养化程度，除了控制外污染源输入外，必须重视湖泊生态功能的修复。生态系统是生物与环境的综合体，一个良好的湖泊水生生态系统由完整的沉水植物群落、浮叶植物群落、漂浮植物群落、挺水植物群落及湿生植物群落共同组成，与水体中的浮游、底栖生物和鱼类组成一个相互依存的生物链，水草茂盛、水质清澈、水产丰盛、通过生物系统对水体氮、磷等营养物质的吸收转换，净化水质，形成生态结构稳定的良好湖泊生态系统.
国内外湖泊治理的经验表明，湖泊治理是一项复杂的系统工程，是一项长期而艰巨的任务。在大型湖泊中利用水生植被治理湖泊富营养化尚是一项探索性工程，目前缺乏对浅水湖泊生态系统的完整研究，尤其是太湖，面积大，水体流动慢，治理更是困难。有必要先进行试验研究，开展示范工程比选高效可行的技术手段，为大规模开展生态治理奠定基础。基于以上原因，太湖流域管理局与2003年委托河海大学和上海水利勘测设计研究院共同编制完成了《太湖水生态修复技术方案》，方案主要内容包括：
(1) 对太湖的水生态现状进行调查研究，针对目前太湖水环境中存在的问题，提出控制对策；
(2) 采用生态治理和强化净化技术进行水源地的水质、生态保护以及入湖河流的水质净化和生态重建研究，为太湖的水生态治理提供可行的集成技术方案；
(3) 研究采用生物－生态技术建设太湖生态堤防，构建稳定、丰富的生态系统，同时满足稳定性、防洪、水利等方面要求；
(4) 在现场调查和方案研究的基础提出示范工程开展地的建议方案并对提出的方案进行比选。
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